Na única vez em que disputou a Libertadores, como campeão da extinta Copa do Campeões de 2002, o Paysandu fez uma campanha marcante. Não só terminou a primeira fase como primeiro de seu grupo como chegou a derrotar o futuro campeão Boca Juniors dentro da Bombonera, por 1 a 0, no primeiro jogo das oitavas-de-final. Na partida de volta, em Belém, o Papão não resistiu, e caiu por 4 a 2. Iarley, autor do Gol da vitória em Buenos Aires, foi contratado pelo time argentino.

 Segue a campanha do Paysandu na Libertadores de 2003:

Sporting Cristal (PER) 0x2 Paysandu.

Estádio: San Martin de Porras.

Gols: Róbson e Sandro.

Paysandu 0x0 Cerro Porteño (PAR).

Estádio: Mangueirão.

Paysandu 3×1 Universidad Católica (CHI).

Estádio: Mangueirão.

Gols: Róbson (2) e Vélber.

Paysandu 2×1 Sporting Cristal (PER).

Estadio: Mangueirão.

Gols: Róbson e Jorginho.

Cerro Porteño (PAR) 2×6 Paysandu.

Estádio: General Pablo Rojas.

Gols: Vélber (2), Róbson (2) e Iarley (2).

Universidad Católica (CHI) 1×1 Paysandu.

Estádio: San Carlos de Apoquindo.

Gol: Sandro.

OITAVAS-DE-FINAL.

Boca Juniors 0x1 Paysandu.

Estádio: La Bombonera.

Gol: Iarley.

Paysandu 2×4 Boca Juniors.

Estádio: Mangueirão.

Números da campanha:

Oitavas-de-final.

8 – jogos:

5 – vitórias:

2 – empates:

1 – derrota:

17 – gols pró:

9 – gols contra:

Maiores artilheiros da equipe:

6: gols: Róbson (Robgol).

3: gols: Iarley e Vélber.

 

Fonte: Revista Placar.