O São José Esporte Clube é um dos times mais antigos do munícipio de Itaboraí, Região Metropolitana do Rio. O áureo-verde foi fundado no sábado, no dia 13 de fevereiro de 1937. Curiosamente, o São José é mais antigo do que a própria Liga Desportiva de Itaboraí (Primeiro de Julho de 1962), no qual disputa as competições da região.
Outro fato interessante é que o time ficou inativo por mais de uma década e retornou em 2009, promento não fechar mais.