1ª FASE
GRUPO A
| 13.09.2016 | DOM BOSCO | 5-1 | UNIÃO |
| 18.09.2016 | UNIÃO | 2-3 | CUIABÁ |
| 26.09.2016 | CUIABÁ | 3-0 | DOM BOSCO |
| 08.10.2016 | DOM BOSCO | 1-1 | CUIABÁ |
| 17.10.2016 | CUIABÁ | 1-2 | UNIÃO |
| 22.10.2016 | UNIÃO | 0-1 | DOM BOSCO |
| J | V | E | D | GP | GC | PG | ||
| 01º | CUIABÁ | 04 | 02 | 01 | 01 | 08 | 05 | 07 |
| 02º | DOM BOSCO | 04 | 02 | 01 | 01 | 07 | 05 | 07 |
| 03º | UNIÃO | 04 | 01 | 00 | 03 | 05 | 10 | 03 |
GRUPO B
| 12.09.2016 | MIXTO | 1-1 | LUVERDENSE |
| 18.09.2016 | LUVERDENSE | 1-2 | MIXTO |
| J | V | E | D | GP | GC | PG | ||
| 01º | MIXTO | 02 | 01 | 01 | 00 | 03 | 02 | 04 |
| 02º | LUVERDENSE | 02 | 00 | 01 | 01 | 02 | 03 | 01 |
SEMI FINAL
| 27.10.2016 | LUVERDENSE | 0-0 | CUIABÁ |
| 28.10.2016 | DOM BOSCO | 1-1 | MIXTO |
| 31.10.2016 | CUIABÁ | 3-1 | LUVERDENSE |
| 14.11.2016 | MIXTO | 0-0 | DOM BOSCO |
FINAL
| 21.11.2016 | MIXTO | 1-2 | CUIABÁ |
| 24.11.2016 | CUIABÁ | 3-2 | MIXTO |
Com estes resultados o CUIABÁ ESPORTE CLUBE sagrou-se campeão da Copa FMF 2016.
Fonte: Jornal A Gazeta e Diário de Cuiabá