O clube foi fundado em 2008 para disputar a Divisão de Acesso do Campeonato Catarinense (Terceira Divisão), o clube fez parceria com o Atlético Clube Chapecó , que tinha inscrição na FCF e estava desativado havia cinco anos. O CTM jogou portanto com o nome do Atlético Chapecó, porém, mandou seus jogos no seu município sede, Guarujá do Sul. Ao decorrer da competição o clube foi suspenso (dia 22 de outubro) pelo não cumprimento de obrigações financeiras perante a Federação.